墩祥街站位于古墩路与墩祥街交叉口,沿古墩路南北走向布置。车站为地下车站,分为站厅、站台两层。地下一层为站厅层,包括乘车购票区域以及后续开放的商业区,地下二层则为站台层。车站共开放A1、B、C、D四个出入口(具体出入口开放信息以车站实际情况为准),其中:
A1出入口通往:幸福里、亲亲家园(一期二期)、三和大街;
B出入口通往:亲亲家园(三期)、桔子里、三墩颐景园、303生活广场、三墩新天地;
C出入口通往:兰韵天城、紫金港湾、杭州市大禹路小学、信鸿花园;
D出入口通往:都市水乡、润达花园、杭州市长阳小学。